Два слоя на одну БД

Работать будет.
Графические данные всегда главенствуют над атрибутами, связь по ID объекта - Sys в таблице.
Если объект с одним и тем же ID будет в обоих графических базах и единой базе атрибутов, просмотр и редактирование атрибутов будет возможно из обоих слоев. Но если объект удалить в одном слое, а затем СЖАТЬ базу - атрибуты навсегда будут удалены из внешней базы (https://www.politerm.com/zuludoc/index.html#zb_browser_squeezefill.html)

Так же хочу отметить ID объекта в слое УНИКАЛЕН и если удалить объект, то новый объект с тем же ID, в графическом редакторе не создать, можно будет только перенести объект из другого слоя наследуя ID (https://www.politerm.com/zuludoc/index.html#edit_group_write.html) или назначить необходимый ID программно, используя объектную модель.